生工技术 | UniProt查询蛋白的相关信息
以人的EGFR为例,打开Uniprot的网站,填入物种和名称,点击search。

点击后在出现的页面中,根据需要目的蛋白的物种以及名称,确定红色箭头为目的蛋白,点击“P00533”进入目的蛋白页面。

进入蛋白页面后,可以看到以下信息左边的列表可以知道蛋白性质的分类,点击后可以快速到达相应位置。打开页面就可以看到蛋白的全称基因的名称以及功能的相关信息。

点击左边的publications中还可以看到与此蛋白相关的文献。

回到原来的页面往下拉,可以看到蛋白相关的其他信息。在功能中可以看到GO分析中的分子功能和生物过程,还有相关催化活性和活性的相关位点等。

在名称及分类中可以看到蛋白质名称,基因名称等,在亚细胞定位中可以看到蛋白的定位位置等。

在病理学相关信息中,可以了解和此蛋白相关的疾病,及相关诱变位点信息及其相关影响等。

在翻译后修饰中,可以看到蛋白的信号肽,具体的氨基酸修饰,磷酸化,二硫键,糖基化位点等。

在表达中,可以看到表达的组织特异性。

在相互作用中,可以看到蛋白亚基的结构,蛋白-蛋白相互作用的相关信息和数据库。


在结构中,可以了解蛋白的二级结构位置以及蛋白的三维结构等。

在蛋白家族和结构域中,可以看到结构域和蛋白家族的一些信息。

在序列中,可以获取蛋白的序列信息,有几个亚型,可以查询到蛋白的分子量,长度,等电点,疏水性等信息。还可以看到自然突变体的信息等。而且可以进入KEGG的相关网站中,了解此蛋白相关的所有通路。



Uniprot可以说是蛋白信息的大百科全书,利用好Uniprot,可以轻松挖掘出非常多有用的蛋白信息。小编也将在今后的推送中,多推出该数据库的使用方法。
