恒温扩增技术
与其他的核酸扩增技术相比,恒温扩增有快速、高效、特异的优点且无需专用的设备,所以它一经出现就被许多学者认为是一种有可能与PCR媲美的检测方法。
当前常见的等温扩增技术有:
环介导等温扩增技术LAMP、
依赖解旋酶等温扩增技术HDA、
依赖核酸序列等温扩增技术NASBA、
重组酶聚合酶扩增RPA、
链替代等温扩增技术SDA、
滚环等温扩增技术RCA、
单引物等温扩增技术SPIA、
核酸快速等温检测放大等……
下面我们介绍几种比较常用的技术:
环介导等温扩增技术 LAMP
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扩增效率高,能够在1 h内有效的扩增1~10拷贝的目的基因,扩增效率是普通PCR的10~100倍
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反应时间短,特异性强,不需要特殊的设备
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对引物的要求特别高
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扩增产物不能用于克隆测序,只能用于判断
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由于其敏感性强,特别容易形成气溶胶,造成假阳性影响检测结果
依赖解旋酶DNA等温扩增技术 HDA
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模拟体内 DNA 复制的自然过程
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在常温下进行,简便、高效、快速
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发展尚不够成熟
依赖核酸序列等温扩增技术 NASBA
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它的引物上带有T7启动子序列,而外来双链DNA无T7启动子序列,不可能被扩增,因此该技术具有较高的特异性和灵敏度。
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NASBA将反转录过程直接合并到扩增反应中,缩短了反应时间。
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反应成分比较复杂
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需要3种酶,反应成本增加
重组酶聚合酶扩增 RPA
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在常温就可以进行PCR反应
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实现了便携式快速核酸检测
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琼脂糖凝胶电泳成像在检测前需要产物纯化
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恒定温度下反应较难避免部分非特异性扩增
滚环等温扩增技术 RCA
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高灵敏度,RCA有很强的扩增能力
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高序列特异性,可以区分单一位点的不同模式
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扩增产物经过磷酸化处理后可直接用来测序
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高通量,RCA可以在靶目标上形成闭合的环状序列,确保RCA产生的信号集中在一点,从而实现原位扩增和载片扩增
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琐式探针常接近100 bp,合成费用较高
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信号检测时存在背景干扰问题
恒温核酸扩增的技术不同,引物设计方法很难相互借鉴。请持续关注生工生物微信公众号,后续将推出相关引物设计内容!
*以上内容参考网络
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