（3) 通过种子区保守型、热力学稳定性等参数进行预测，适合需要高精确度种子区匹配研究。

03miRDB网站的基本步骤

小编以人的hsa-let-7b-5p与靶基因FASLG为例：

步骤一：miRDB首页及搜索页面

打开miRDB网站按照图1中所示，按照顺序点击Target Search（检索数据库中已知的miRNA-靶基因关系）、选择miRNA物种、填写特定miRNA名称（或靶基因名称）、点击GO。

图1. miRDB首页及搜索页面

步骤二、进入miRNA预测的靶基因页面

提交筛选信息后，进入图2即可获取miRNA的靶基因预测信息，信息很多，小编建议重点关注Target Score评分和是否包含特定的靶基因这两个项目。

（1）Target Score评分：位点评分越高，排在前面的基因评分较高，靶点置信度与靶点结合性高一些；

（2）如果需要找特定的基因，可通过Ctrl+F搜索靶基因名称即可；

（3）需要具体了解miRNA与靶基因具体结合位点的信息，点击目的靶基因对应的Details。

图2. 预测靶基因页面

步骤三、miRNA与靶基因详细的信息页面

点击特定靶基因对应的Details，进入图3中miRNA与靶基因详细的信息页面即可查看二者的详细信息以及结合位点序列的组成。若预测到多个靶点位置，网页不会体现哪个靶点评分更高，哪个靶点更好，需要通过实验进行验证。

图3. miRNA与靶基因信息页面

04TargetScan网站操作流程

小编以人的hsa-let-7b-5p与靶基因FASLG为例：

步骤一、TargetScan首页填写

进入TargetScan网站，按照图4中顺序点击选择miRNA物种、填写靶基因名称、填写miRNA名称、点击Submit即可完成该页面的信息填写与提交。

图4. TargetScan首页

步骤二、若基因存在多个转录本情况

若基因有多个转录本相反则直接进入步骤三，需选择以哪个为准预测，一般选择第一个最常用的，点击ID。

图5. 存在多个转录本情况页面  

步骤三、结果页面解析

结果页面如图6可得到的信息很多，图6中进行标注的参数可作为重点参考信息，建议重点考量以下参数：

（1）保守序列比不保守序列置信度高，保守性低的序列评分相对较低；

（2）确定靶点位置、基因名称、miRNA名称；

（3）Predicted consequential pairing of target  region (top) and miRNA (bottom)列：
    a) 上方序列为靶基因3'UTR序列，下方序列为miRNA序列
    b) 白色部分表示靶基因与miRNA结合的位点

（4）Context++ score：绝对值越大，置信度越高；

（5）Context++ score percentile列：靶点评分越高置信度越高；

（6）Site type列：种子区2~8位结合为常规结合，结合位点越多置信度越高。

                       图6. 结果页面

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