从序列到结构，一酶定乾坤 - 高特异性V8蛋白酶助力蛋白质组学深度解析

V8蛋白酶（Endoproteinase Glu C，Staphylococcal Protease Protease V8，蛋白内切酶 Glu-C）属于丝氨酸蛋白酶家族，能特异水解谷氨酸（Glutamic acid、E）或天冬氨酸（Aspartic acid、D）残基羧基侧肽键。在pH 7.8的NH4HCO3和pH 4.0的CH3COONH4缓冲液中识别并切割Glu羧基端肽键，在pH 7.8的磷酸盐缓冲液中识别并切割Glu或Asp羧基端肽键，且对Glu的水解速率高于Asp。

在温和条件下进行蛋白多肽链的切断，不会引起氨基酸残基侧链的修饰（氧化、卤化、脱酰胺等）。而且，被修饰残基（糖链、类脂体、磷酸、硫酸等的结合部位）的肽一般以完整形态被回收，而且具有良好的回收率。如果采用同样的消化条件可以实现高再现性的分段。使用底物特异性高的酶进行蛋白质的结构分析，可预测氨基酸组成的大体片段数和平均大小，并且重要的是可以避免由于部分切断（非特异性切断），导致分离的复杂化。

本品由Drapeau系列的Staphylococcus aureus（V8菌株）分离而成，是特异性切断谷酰胺产的羧基侧链的酶。分别切断磷酸系列缓冲液中包含谷氨酸及天冬氨酸羧基侧链、氨系列缓冲液中包含谷氨酸羧基侧链的肽结合酯结合。因为其高底物特异性，本品被用于各种蛋白质结构序列分析时使用。在进行蛋白质酶切测序、肽图谱分析和肽质量指纹图谱分析中使用时，可以单独使用或与其他蛋白酶混合使用。