SurePrint文库制备工艺
● 基于SurePrint技术，使用ATCG四种碱基作为“墨水”
● 碱基均匀地沉积在特殊制备的芯片上
● 在整个芯片上，寡核苷酸以一次一个碱基的方式堆积, 直到达到所需的长度
● 将合成好的序列从芯片上切割下来，混合、冻干后以单管形式提供
● Oligo文库可通过重悬、扩增，被应用于任何下游实验应用
图1. 安捷伦喷墨打印技术工作流程
文库质量
寡核苷酸文库的选择和设计，有多个参数需要考虑，其中最重要的两点：
1）保真度：直接涉及文库错误率（多少碱基出现1个错误）：
图2. 通过MiSeq测序验证保真度，平均错误率1/2265
2）序列均一度：安捷伦DNA合成技术通过合理的算法保证所有序列分布均一，即使是合成序列非常复杂的文库
图3. MiSeq测序分析验证序列均一度
文库优势
● 一致、高复杂性、平行合成
● 行业领先的保真度和均一性
● 可为几乎任何应用或实验方法提供定制设计
● 最多可合成244,000 寡核苷酸
● 支持30-230 nt的寡核苷酸长度
百变应用
● CRISPR文库筛选：靶点发现、功能基因组研究
图 4. 安捷伦的大规模并行寡核苷酸合成平台是获得 CRISPR 文库的基础。此外，还提供多种多样的仪器和试剂帮助您获得理想的 CRISPR 筛选结果
● 蛋白质设计：一种了解蛋白质工作原理的创新方法
美国华盛顿大学David Baker团队使用SurePrint 230bp oligo文库设计针对目标蛋白的迷你粘合剂（minibinder）肽序列，用来高通量筛选最合适的序列。Dr. Coventry认为安捷伦是帮助科研工作者通往真实世界的大门，在安捷伦提供寡核苷酸文库之前，他所做的工作都是停留在电脑端、不真实的。在使用安捷伦寡核苷酸文库后，团队先后设计和表达了数百万种蛋白质。
图5. 数以百万计的蛋白质实验表征和优化步骤[1]
● 突变发生
● 酶工程
● 基因组装
● 疾病治疗和测试
● 大规模平行报告分析(MPRA)
● 合成生物学、生物传感器
● DNA数字存储
● 传染病研究
● …………
更多精彩应用，期待您的探索发现~
Reference:
[1] Cao, L., Coventry, B., Goreshnik, I. et al. Design of protein-binding proteins from the target structure alone. Nature 605, 551–560 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-04654-9
