DNA编码化合物库(DEL)与NanoBRET™ Target Engagement Assay共同加速药物研发
美国威斯康星州麦迪逊市。(2023年8月1日)
一项新研究展示了DNA编码化合物库(DNA Encoded Library, DEL)与NanoBRET™ Target Engagement技术的结合如何加速早期药物研发。据《细胞化学生物学(Cell Chemical Biology)》杂志报道,Promega公司与药明康德的研究人员从通过 DEL 筛选确定的分子中生成了新的化学探针。该研究为开发新型NanoBRET™ Target Engagement Assay(TE)(针对研究较少的蛋白质类)提供了新的机会,加速推进了从苗头化合物到先导化合物的研发,从而发现潜在的新型治疗方法。
生成新型基于DEL的化学探针
DEL是早期药物发现阶段快速筛选数十亿分子的重要工具,其应用获得广泛关注。每个分子均标记一个较短的DNA“标签”,可用于识别成功与靶点结合的分子。据《细胞化学生物学(Cell Chemical Biology)》杂志报道,Promega公司与药明康德的科研人员通过利用这些大规模化合物库中筛选出的分子,研究开发出了新型的化学探针。这些化学探针可与NanoBRET™ Target Engagement Assay 结合使用, NanoBRET™ Target Engagement Assay是一种可在活细胞内研究化合物与其靶蛋白相互作用的工具。
作者对药明康德41个已建立的DNA编码化合物库(DEL)中的168亿个化合物进行筛选,以筛选出可与Aurora kinase A (极光激酶A,一种与某些癌症浸润性生长有关的蛋白质)相互作用的化合物。作者识别出两种具有代表性且可与靶点结合的苗头化合物,并开发出一种可使用荧光基团替代每种苗头化合物DNA标签的方法。荧光基团可在活细胞中进行NanoBRET检测时生成发光信号。研究团队发现,这种新型探针可用于有效表征针对极光激酶A的抑制剂,提供亲和力、选择性和细胞通透性等关键作用特性。
“作者意识到DEL筛选结果不仅可以识别与蛋白质结合的化学物质,还可以确定连接示踪剂的位置”,结构基因组研究联盟首席执行官Aled Edwards说道。该联盟建立了一种公私合作伙伴关系,致力于开发开放获取的化学探针,从而支持药物研发。“想象一下,如果对于所有的人类蛋白质都能找到DEL苗头化合物,那将会如何?”
推进药物研发
作者认为,DEL对于需要验证活细胞中目标蛋白的化合物与靶蛋白相互作用的化学生物学家大有裨益。尤其是对现在还未开发出相应的化学探针且研究不足的蛋白质效果显著。另外,他们指出,NanoBRET™检测通过提供可用于识别最有前景的先导化合物的数据,帮助药物发现研究人员推进其工作流程。
他们认为,“我们的研究结果表明,基于DEL的BRET探针不仅有助于在DEL识别出的化合物中优先选择更好的化合物进入后续优化流程,而且还可作为通用的活细胞筛选工具,用于研究目标蛋白更广泛的化学型多样性。”
更多详情可阅读开放获取论文,“DEL助力BRET探针研发及其在细胞中化合物—靶点相互作用检测中的应用”。
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